Οι ερευνητικοί άξονες των Εργαστηρίων Αμπελουργίας του ΙΕΛΥΑ σε Αθήνα και Ηράκλειο, σε συνεργασία με τα Εργαστήρια Ιολογίας, Γεωργικής Βιοτεχνολογίας, Γενετικής Βελτίωσης και Δενδροκομίας Υποτροπικών Φυτών του ΙΕΛΥΑ, περιλαμβάνουν:
(α) τη συλλογή, πολλαπλασιασμό και διατήρηση πιστοποιημένου ως προς την ποικιλιακή ταυτότητα και τη φυτοϋγεία πολλαπλασιαστικού υλικού των αυτόχθονων ποικιλιών ενδιαφέροντος, με έμφαση στις σπάνιες ποικιλίες,
(β) την αξιολόγηση της επίδρασης της κλιματικής αλλαγής στην αμπελοκαλλιέργεια και την ανάπτυξη στρατηγικών ορθολογικής διαχείρισης του νερού, ισορροπημένης λίπανσης και αποτελεσματικής φυτοπροστασίας των αμπελώνων,
(γ) την εκτίμηση της προσαρμοστικότητας διαφορετικών συνδυασμών εμβολίων-υποκειμένων σε ποικίλα περιβάλλοντα και τη διερεύνηση του οινικού δυναμικού των ποικιλιών και
(δ) την ανάπτυξη πρωτοκόλλων in-vitro πολλαπλασιασμού. Την τρέχουσα χρονική περίοδο, τα Εργαστήρια Αμπελουργίας του ΙΕΛΥΑ συμμετέχουν σε 7 ερευνητικά προγράμματα, αντικείμενο των οποίων είναι τα πρώτα στάδια της κλωνικής επιλογής στο αμπέλι (ιχνηλασιμότητα, γενετική ταυτοποίηση και πιστοποίηση της φυτοϋγείας του πολλαπλασιαστικού υλικού, διατήρηση των υποψήφιων κλώνων σε διχτυοκήπια)