Η έρευνα που σχετίζεται με τα λαχανικά στο ΙΕΛΥΑ επικεντρώνεται στα παρακάτω αντικείμενα:
Α) Τη φυσιολογία, θρέψη, αβιοτικές καταπονήσεις των οπωροκηπευτικών. Με σκοπό την βελτιστοποίηση των συνθηκών καλλιέργειας για υψηλότερη παραγωγικότητα.
Β) Τις αλληλεπιδράσεις φυτών παθογόνων και την επαγωγή της άμυνας των φυτών και τις εφαρμογές τους. Για τον εντοπισμό και την αξιοποίηση των μηχανισμών των φυτών για υψηλότερη αντοχή στους εχθρούς και τις ασθένειες.
Γ) Τη μετασυλλεκτική φυσιολογία φρούτων και λαχανικών. Για την βελτιστοποίηση των συνθηκών αποθήκευσης και την καλύτερη πρόσβαση των νωπών προϊόντων στις αγορές.
Δ) Δημιουργία μοντέλων απορρόφησης θρεπτικών στοιχείων για τη βελτιστοποίηση της χρήσης νερού και λιπασμάτων στην υδροπονική καλλιέργεια λαχανικών.
Ε) Αξιολόγηση και εφαρμογή περιβαλλοντικά φιλικών υλικών ως υποστρωμάτων υδροπονικής καλλιέργειας λαχανικών.
ΣΤ) Μελέτη των θρεπτικών απαιτήσεων και των συνθηκών των θερμοκηπιακών καλλιεργειών λαχανικών.
Στο πλαίσιο και των έξι παραπάνω αξόνων, πραγματοποιείται μια ευρεία γκάμα αναλύσεων στο Εργαστήριο για την εκτίμηση της φυσικοχημικής σύστασης και της ποιότητας των νωπών φρούτων και λαχανικών.
Στον μελλοντικό σχεδιασμό για το αμέσως προσεχές διάστημα περιλαμβάνεται η δυνατότητα αξιολόγησης γονοτύπων σε παράγοντες καταπόνησης που σχετίζονται και με την κλιματική αλλαγή (ξηρασία, αλατότητα). Ιδιαίτερη βαρύτητα θα δοθεί στην αξιοποίηση «παραδοσιακών ποικιλιών» κηπευτικών με σκοπό την αξιοποίηση της υψηλής προσαρμοστικότητας τους στις τοπικές εδαφοκλιματικές συνθήκες.
Το Εργαστήριο Λαχανοκομίας στο Ηράκλειο, διευθύνεται από τον Δρ. Γ. Τσανικλίδη.Η έρευνα που επικεντρώνεται στην φυσιολογία των κηπευτικών, πραγματοποιείται σε συνεργασία με τον Δρ. Κ. Τζεράκη που ειδικεύεται στις καλλιέργειες εκτός εδάφους και στα παραγωγικά συστήματα κηπευτικών που διευθύνει το Εργαστήριο Υδροπονίας και εδρεύει στα Χανιά. Η έρευνα σχετικά με τις αλληλεπιδράσεις φυτών-παθογόνων πραγματοποιείται σε συνεργασία με τους, Δρ. Εμ. Μαρκάκη που ειδικεύεται εκτός των άλλων, στην μυκητολογία κηπευτικών, την Δρ. Π. Παππή ιολόγο κηπευτικών, Δρ.Ε. Τζωρτζακάκη νηματωδολόγο και Δρ. Κ. Βαρίκου εντομολόγο που μελετά τις επιπτώσεις στα φυτά από τα φυτοφάγα έντομα.